Медицинский научно-практический портал
ISSN 2687-1181 (Online) ISSN 1560-5175 (Print)
585

Неизученный геном человека – масштаб проблемы и пути решения

Как объяснить "темные пятна" в геноме человека?

Секвенирование генома человека позволило понять, насколько большая часть генетической информации, кодирующей различные белки, все еще не исследована, и отсутствует понимание многочисленных функций, осуществляемых ДНК.

Основными причинами для такого пробела являются недофинансирование этой научной сферы, преимущественный фокус исследователей на гены, по которым уже имеется определенная степень понимания, а также различные технические сложности. В то же время актуальность изучения неисследованных генов и белков сложно переоценить, поскольку они могут отвечать за критически важные для функционирования клеток функции и представлять большой потенциал для открытия новых биологических механизмов и, как следствие, новых возможностей для их применения, в том числе в лечении.

В целях решения этой проблемы учеными из Оксфорда и Кембриджа был разработан проект – www.unknome.org – «неизвестном» (на манер «неизвестный геном»). Об открытии данного веб-проекта опубликована работа в журнале PLOS Biology.

На сайте проекта каждому белку присваивается степень изученности, отражающая количество научных публикаций об их функциях, степень соответствия между различными биологическими видами, клеточная компартментализация и другое. На основании таких оценок, у тысяч различных белков степень изученности находится на уровне, близком к нулю. База данных обладает открытым доступом и может дополняться другими исследовательскими группами.

В качестве эксперимента учеными были отобраны 260 генов человека со схожей структурой генов мухи, степень изученности которых находилась на минимальном уровне (менее 1 балла). Для большинства из этих генов нокаут гена у лабораторных мух был несовместим с жизнью. Частичный нокаут генов в определенных тканях позволил продемонстрировать, что многие из них отвечают за такие функции как фертильность, развитие, рост тканей, контроль качества белков и устойчивость к клеточному стрессу.

Таким образом, многочисленные гены, отвечающие за базовые функции, до сих пор не изучены на должном уровне. Созданная база данных Unknome является эффективной платформой для идентификации таких неизученных генов и создания исследовательского фокуса.

 

Материал подготовлен в рамках проекта «Медицина в точке бифуркации». Проект поддержан грантом Минобрнауки России в рамках федерального проекта «Популяризация науки и технологий»

 

Источник: João J. Rocha et al. Functional unknomics: Systematic screening of conserved genes of unknown function // PLOS Biology. 2023

The Unknome

изображение ресурса
Lvrach.ru | Профессиональный телеграм-канал для практикующих врачей
Подписаться

Календарь событий

Конференция 30 мая
Онлайн-формат
Проект 30 мая
Образовательный проект DiaGastro «Первичный и повторный прием пациента с функциональными заболеваниями ЖКТ»

Организатор: ФГБОУ ВО «Российский университет медицины» Минздрава России

г. Кисловодск, ул. Шаумяна, 31/33, Отель Грин Резорт
изображение ресурса
Ag: Актуальная гинекология
Телеграм-канал для практикующих гинекологов
Подписаться
изображение ресурса
Сообщество в ВК
Подписаться

Мы используем cookie, чтобы сделать наш сайт удобнее для вас. Оставаясь на сайте, вы даете свое согласие на использование cookie. Подробнее см. Политику обработки персональных данных