Протоковая аденокарцинома поджелудочной железы (АКПЖ) – это злокачественная опухоль, развивающаяся из железистых клеток, один из самых агрессивных и наиболее распространенных видов рака поджелудочной железы. Она возникает в результате предраковых поражений в поджелудочной железе (панкреатические интраэпителиальные неоплазии появляются за несколько лет до манифестации злокачественной опухоли).
Учёными из Johns Hopkins Kimmel Cancer Center выявлены ключевые маркеры прогрессирования рака поджелудочной железы. Результаты исследования опубликованы в Cell Systems.
Ранее разработанные методы анализа – массовое секвенирование и секвенирование отдельных клеток – способны фиксировать экспрессию генов раковых клеток и других типов клеток вокруг опухоли, но с их помощью невозможно сформировать пространственные соотношения между этими типами клеток.
Учёные разработали новый конвейер трехстороннего анализа для картирования изменений экспрессии генов на основе пространственной транскриптомики – метода, используемого для измерения и картирования экспрессии генов в срезе ткани.
Было изучено прогрессирование поражений панкреатических интраэпителиальных неоплазий от низкой до высокой степени. На основании данных трёхстороннего анализа исследователи пришли к выводу о том, что пролиферация клеток постепенно увеличивается, в то время как воспалительная реакция снижается. На стадии предрака были обнаружены ассоциированные с раком фибробласты, а клетки внутри и вокруг панкреатических интраэпителиальных неоплазий оказывали иммуносупрессивное действие до возникновения инвазивной протоковой аденокарциномы поджелудочной железы.
Исследователи планируют использовать полученные данные для создания тестов раннего выявления маркеров протоковой аденокарциномы поджелудочной железы.
