Ишемическая болезнь сердца (ИБС) – одна из ведущих причин смерти и инвалидизации населения. Распространенность ИБС в мире составляет порядка 6.7%, в России – 5.1-5.3%, а среди коренных американцев ИБС встречается в два раза чаще, чем в общей популяции и составляет около 12%.
Одним из ключевых биомаркеров высокого сердечно-сосудистого риска является метилирование ДНК – обратимая ковалентная модификация молекулы, которая заключается в присоединении метильной группы к цитозину в составе CpG (цитозин–фосфат–гуанин)–динуклеотидов в позиции C5 пиримидинового кольца.
Чтобы понять, может ли метилирование повышать риск развития ИБС, ученые из Колумбийского университета проанализировали образцы крови пациентов (12 общин американских индейцев, проживающих на территории 4 штатов США), собранные в период с 1989 по 2018 г. в рамках исследования the Strong Heart Study (SHS; n=2321; медиана возраста 55 лет, IQR [49–62]; 1359 (58.6%) женщин; среднее время наблюдения – 9.1±9.2 лет). Риск развития ИБС оценивали в пяти когортах: SHS, the Women’s Health Initiative (WHI; n=1874; среднее время наблюдения – 15.8±5.9 лет), the Framingham Heart Study (FHS; n=2128; среднее время наблюдения – 7.7±1.8 лет) и the Atherosclerosis Risk in Communities Study (ARIC–Black, n=2114; среднее время наблюдения – 20.9±7.2 лет и ARIC–White, n=931; среднее время наблюдения – 20.9±7.2 лет) с помощью модели пропорциональных рисков Кокса. Данные были скорректированы по наличию сопутствующих факторов риска.
За весь период исследования ИБС была выявлена у 749, 531, 143, 350, 121 пациентов групп SHS, WHI, FHS, ARIC–Black и ARIC–White, соответственно. Общее число CpG сайтов в выборке SHS составило 407224.
Среди 550 метилированных CpG сайтов (differentially methylated CpG positions, DMPs), 33 были общими для 3–4 когорт, а 10 были связаны с увеличением вероятности развития ИБС (напр., в когортах cg16604233 и cg09926486 отношение рисков, ОР 0.86; 95% ДИ [0.78–0.95]) и ОР 1.23; 95% ДИ [1.08–1.39], сответственно). Направленность влияния некоторых DMPs различалась между группами пациентов.
Ученым также удалось определить генетические последовательности и группы генов, наиболее подверженные метилированию.
Таким образом, метилирование ДНК является независимым фактором риска сердечно-сосудистых заболеваний, в частности ИБС, а характер метилирования CpG сайтов различается между группами пациентов, проживающих на разных географических территориях.
